Poprawienie dokladnosci prenatalnego badania przesiewowego za pomoca analizy liczby kopii DNA

Pomimo zgłaszanych swoistości ponad 98% dla nieinwazyjnego prenatalnego badania przesiewowego z użyciem DNA bez komórek uzyskanego z krwi matek, opublikowane pozytywne wartości predykcyjne dla trisomii 21, 18 i 13 wynoszą 93%, 64% i 44%, Odpowiednia rozbieżność między swoistością a wartością predykcyjną pozytywną wynika z niskiej częstości występowania tych zaburzeń, technicznych ograniczeń testów i zmienności biologicznej, takich jak zanikający bliźniak lub ograniczony mozaikowy łożyskowy. Snyder i współpracownicy opisali dwa przypadki fałszywie pozytywnych wyników nieinwazyjnego prenatalnego badania przesiewowego pod kątem trisomii 18, które później okazało się być wynikiem matczynego mikrodukcjonowania chromosomu 18.3 Przeprowadziliśmy nieinwazyjne badania prenatalne za pomocą sekwencjonowania całego genomu, metodą obejmującą sekwencjonowanie fragmentów DNA, które w agregacie reprezentują prawie cały genom. To podejście pozwala nam wygenerować kariogram, który graficznie reprezentuje wyniki z całego genomu. Po przeczytaniu raportu Snydera i wsp., Wprowadziliśmy proces, w którym dla każdego pozytywnego wyniku uzyskanego na nieinwazyjnym badaniu prenatalnym, wygenerowaliśmy i zbadaliśmy kariogram dla dotkniętego chromosomu. Aby uzyskać prawdziwy pozytywny wynik, odczyty sekwencji są zwiększone na całym chromosomie. Gdy obecne jest macierzyńskie mikropróbkowanie, tylko region chromosomu, który jest duplikowany, jest reprezentowany przez zwiększoną liczbę odczytów sekwencji. Podczas oceny danych pochodzących od serii 31 278 kobiet w ciąży, które przeszły takie badania przesiewowe, nasz proces pozwolił nam zidentyfikować 61 kobiet, u których mikroduplikacje matki występujące na chromosomach 13, 18 i 21 wykazały fałszywie dodatnie wyniki. Dopóki nie byliśmy pewni, że kariogramy prawidłowo przewidują mikroduplikacje macierzyńskie, potwierdziliśmy podejrzenie mikrodu kcji za pomocą analizy mikromacierzy (CytoScan HD Array, Affymetrix). Następnie przeprowadzono analizę mikromacierzy matek według uznania zamawiającego lekarza. Doradca genetyczny skontaktował się z lekarzem w raporcie, który zawierał opis podejrzenia zastosowania mikropłytek matki oraz ofertę potwierdzającej analizy mikromacierzy (bez opłat dla pacjentów z nieubezpieczonymi chorobami). Tabela 1. Tabela 1. Identyfikacja mikropłytek matczynych jako źródło wyników fałszywie pozytywnych w nieinwazyjnych badaniach prenatalnych. Analiza mikropłytek wykazała obecność macierzyńskiego mikropłytkowania we wszystkich testach potwierdzających, które przeprowadzono. Identyfikacja mikrodulikacji matczynych jako źródła fałszywie dodatnich wyników poprawiła pozytywne wartości prognostyczne naszego badania do 98% dla trisomii 21, 92% dla trisomii 18 i 69% dla trisomii 13 (Tabela 1). Prawdziwie pozytywne wyniki dla trisomii 21 potwierdzono za pomocą analizy kario typu lub mikromacierzy amniocytów. Prawdziwie dodatnie wyniki dla trisomii 13 i 18 zostały potwierdzone za pomocą charakterystycznych nieprawidłowości ultrasonograficznych lub analizy amniocytów. Analizy te nie miały wpływu na ujemną wartość predykcyjną badania prenatalnego, ponieważ nie znaleźliśmy żadnych dowodów ultrasonograficznych na nieprawidłowości płodu sugerujące trisomię lub nieprawidłową diagnozę prenatalną. Nie otrzymaliśmy zawiadomienia od lekarza prowadzącego lub neonatologa o narodzinach chorego niemowlęcia. Ponieważ nie było znanych dzieci z trisomią 13 lub 18, obliczyliśmy ujemną wartość predykcyjną 100%. Jedno niemowlę urodziło się z trisomią 21, co spowodowało ujemną wartość predykcyjną większą niż 99,9%. Charles M. Strom, MD, Ph.D. Megan D. Maxwell, MD Renius Owen, Ph.D. Quest Diagnostics Nichols Institute, San Juan Capistrano, Kalifornia Obsługiwany przez Quest Diagnostics, który zapewniał wsparcie płac i pomoc redakcyjną w przygotowaniu tego listu. Formularze ujawnień dostarczone przez autorów są dostępne wraz z pełnym tekstem tego listu na stronie. 3 Referencje1. Bianchi DW, Parker RL, Wentworth J, i in. Sekwencjonowanie DNA w porównaniu do standardowego badania prenatalnej aneuploidii. N Engl J Med 2014; 370: 799-808 Bezpłatny, pełny tekst Web of Science Medline 2. Wang JC, Sahoo T, Schonberg S, i in. Dyskordowe nieinwazyjne badania prenatalne i wyniki cytogenetyczne: badanie 109 kolejnych przypadków. Genet Med 2015; 17: 234-236 Crossref Web of Science Medline 3. Snyder MW, Simmons LE, Kitzman JO, i in. Odmiana liczby kopii i fałszywie dodatnie prenatalne wyniki badań aneuploidalnych. N Engl J Med 2015; 372: 1639-1645 Bezpłatny, pełny tekst Web of Science Medline Materiał uzupełniający (2) [hasła pokrewne: dobry endokrynolog kielce, dermatologia estetyczna, leczenie endometriozy ]

[przypisy: pirymidyna, usg jamy brzusznej bydgoszcz, przymiotno kanadyjskie ]